ご入稿いただいたデータのサイズが合っていない可能性がございます。

まずはセルフチェック入稿画面上にある「印刷カラー」、「解像度」、「塗り足し」設定が原稿と合っているかどうかご確認ください。
設定に問題がないでしたら、次はデータにトンボが表示されているかどうかご確認ください。
トンボがあったら、原稿のサズはトンボが含まれますので大きくなります。
Clip Studio EXをご利用の場合、「裁ち落としまで」書き出してください。